Das Asia University Hospital hat in Zusammenarbeit mit Microsoft Taiwan und Atgenomix, einer Genomtechnologiefirma, ein zentrales System zur Genomanalyse in der Cloud etabliert. Dieses System, das auf Microsoft Azure in Taiwan basiert, schafft die „Asia University Hospital Precision Medicine Sustainability Platform“ und fördert die Entwicklung von präziser Medizin und klinischer Forschung. Damit wird das Asia University Hospital zum ersten erstklassigen medizinischen Zentrum in Taiwan, das ein Kernsystem für die Genomanalyse in die Cloud integriert.
Der Geschäftsführer von Microsoft Taiwan, Lien Chih-hsiang, erläuterte, dass das Asia University Hospital die Analyse von Genomdaten in der Azure-Region in Taiwan implementiert hat. Damit wird nicht nur ein Vorgang für erstklassige medizinische Zentren in Taiwan geschaffen, sondern es ist auch das erste Projekt in Asien, das die Gensequenzierung von Krebserkrankungen und seltenen genetischen Erkrankungen in der Azure-Cloud durchführt. Die cloudnative Struktur, lokale Compliance, niedrige Latenz und elastische Rechenleistung verwandeln umfangreiche Genomdaten in sofortige Einblicke.
Microsoft hebt hervor, dass dieses System die Azure-Region in Taiwan nutzt, um die Analyse von Gensequenzierungsdaten in einer sicheren, konformen und latenzarmen cloudnativen Umgebung zu beschleunigen. Damit wird das Krankenhaus unterstützt, die Identifizierung und das Gesundheitsmanagement von Hochrisikopatienten mit genetischen Variationen schrittweise zu verbessern. Das System könnte in verschiedenen Lebensphasen, von gesund über vorerkrankt bis erkrankt, klinische Hinweise geben, die Frühwarnungen ermöglichen und zeitgerechte Interventionen unterstützen, um das Risiko von Krankheiten zu verringern.
Um die Analyseeffizienz und Flexibilität zu erhöhen, hat das Asia University Hospital in Zusammenarbeit mit Atgenomix seine eigene Genomanalysesystem-Plattform Atgenomix Seqslab auf Azure aufgebaut. Diese Integration von elastischer Rechenleistung und automatisierten Prozessen ermöglicht eine schnelle Verarbeitung großer Mengen von Genomdaten und beschleunigt die Umsetzung von personalisierter präziser Medizin und klinischer Forschung.
Zusätzlich hat das Asia University Hospital einen Genoma-Datensee gebaut und aktualisiert diesen kontinuierlich. Quartalsweise oder halbjährlich können sie Hunderte von Genomdaten von getesteten Subjekten hochladen und sicher in Azure Data Lake speichern. Jedes getestete Subjekt hat ungefähr 700.000 genetische Variationen, was ein bedeutendes Datenvolumen darstellt, welches als wichtige Grundlage für künftige Analysen oder Studien dient.
Um den wachsenden Datenmengen gerecht zu werden und die Analyseeffizienz zu verbessern, integriert das System weiter die GPU-beschleunigte Genomanalyse-Software NVIDIA Parabricks. Dies erhöht die Verarbeitungseffizienz erheblich und reduziert die Analysezeit von zuvor vier Stunden auf nur zehn Minuten. Bei der kombinierten Analyse des gesamten Genoms von beispielsweise 2500 getesteten Subjekten kann dies in unter 40 Stunden erfolgen, was eine Effizienzsteigerung um das 16-fache darstellt.
Der CEO von Atgenomix, Chang Ming-tai, äußerte, dass die Microsoft Azure Cloud-Plattform in der Lage sei, große und schnelle Berechnungs- sowie Speicheranforderungen zu erfüllen, wodurch präzise Medizin zunehmend in der klinischen Anwendung verankert wird.
